■2013年11月19日現在
| チーム名 | 地域 | 詳細 |
|---|---|---|
| 帯広北 | 北海道 | プリンスリーグ北海道1位 9勝2敗3分 |
| ベガルタ仙台ユース | 東北１ | プリンスリーグ東北1位 14勝2敗2分 |
| 盛岡商業 | 東北２ | プリンスリーグ東北3位 9勝7敗2分 ※2位青森山田セカンドはAチームプレミアリーグ参入のため、不参加 |
| 前橋育英高校 | 関東１ |
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| 柏レイソルU18 | 関東２ |
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| 関東３ |
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| 星稜高校 | 北信越１ | プリンスリーグ北信越1位 15勝1敗2分 |
| アルビレックス新潟ユース | 北信越２ | プリンスリーグ北信越2位 14勝2敗2分 |
| ジュビロ磐田U18 | 東海１ | プリンスリーグ東海1位 14勝2敗2分 |
| 藤枝東 | 東海２ | プリンスリーグ東海2位 10勝5敗3分 |
| 大阪桐蔭 | 関西１ | プリンスリーグ関西1部1位 12勝3敗3分 |
| 京都橘 | 関西２ | プリンスリーグ関西1部2位 12勝4敗2分 |
| 東山 | 関西３ | プリンスリーグ関西1部3位 11勝4敗3分 |
| 中国 |
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| 愛媛FCユース | 四国 | |
| 九州 |
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【プレミアリーグ参入戦】
12/14（土）・12/16（月）開催
※上記日程は変更になる場合があります。
大会方式
全国より選出された20チームを10チームずつに分けてそれぞれホーム＆アウェイ方式の総当たり戦（180試合）を実施。EAST及びWESTの優勝チームはチャンピオンシップに出場する。
各リーグの下位2チームは、次年度の高円宮杯U-18サッカーリーグ プリンスリーグへ自動降格する。過去3年間の全国大会の成績ポイントを参考に出場枠を決定した各地域の高円宮杯U-18サッカーリーグ プリンスリーグ上位チームは、16チームが本大会参入戦への出場資格を獲得し、参入戦で2勝した4チームは次年度の本大会出場権を獲得する。
参加チームおよびその数
高円宮杯U－18サッカーリーグ2012 プレミアリーグの東西上位8チーム、および9地域のプリンスリーグ上位チームによるプレミアリーグ参入戦で2勝した4チームが出場する。
※上記により割り当てられた出場チーム数（計20チーム）
北海道（1）、東北（2）、関東（5）、北信越（1）、東海（3）、関西（4）、中国（1）、四国（0）、九州（3）
[注]（ ）内がチーム数、各地域の出場チームは次の通り